Bu yazıyı farkeden okul idaresi de, B.A. ve arkadaşı hakkında disiplin soruşturması başlattı. Olayın ardından öğrencilerden birinden de yaptığından pişman olduğuna ilişkin yazı alındığı da ileri sürüldü.
Soruşturmadan haberdar olan Çağdaş Hukukçular Derneği İzmir Şubesi de, tepkisini yazılı açıklamayla duyurdu. Çağdaş Hukukçular Derneği adına yapılan açıklamada, “Öğrencileriniz vicdanını dinledi. Bunun için, okul yönetiminiz tarafından soruşturmayla sindirilmeye, cezalandırılmaya çalışılıyorlar. 1888 yılında kurulan bu köklü okul adaletsizliğin değil, vicdanlı, onurlu öğrencilerinin yanında olmalıdır. Sizler, yüz akı bu çocuklarla ancak gurur duymalısınız.
Meşru ve haklı talepleri dile getiren öğrencilere açılan soruşturmalar, ifade özgürlüğüne yönelmiş açık bir saldırıdır. Bir eğitim kurumu için utanç vesilesi olan bu soruşturmalar derhal geri çekilmelidir. Bu okulun onurlu öğrencilerini cezalandıramazsınız. Binlerce mezununuz, İzmir Atatürk Lisesi’nde öğrenim görmekle gurur duyan binlerce öğrenciniz okullarına bu kara lekenin sürülmesine izin vermeyeceklerdir. Onlara da buradan çağrımızdır, Berkin’in arkadaşlarına sahip çıkın. İzmir Atatürk Lisesi’ne bu kara lekenin sürülmesine izin vermeyin” denildi.